对于女性，HPV检查和宫颈涂片检查类似，其检查目的是筛查是否存在高危类型的HPV感染。如果是30岁及以上的 女性，建议同时做宫颈涂片和HPV筛查，每5年重复一次。这种筛查方法安全有效。30岁以下的女性不主张进行HPV高危类型的筛查，因为一过性HPV感染 在该人群中会很高。
对于男性，HPV感染的检查主要靠临床观察，如生殖器疣或寻常疣等。对于容易导致恶性肿瘤的HPV 16和HPV 18，目前还没有推荐在男性中进行常规检查。但对于有HIV感染或男性同性性行为者，应和有经验的医生商量决定是否进行肛门镜检。
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